Если часы не герметичны: при низком атмосферном давлении, и как крайний случай - в ваккууме уменьшается сопротивление среды качанию маятника. Амплитуда увеличивается, соотв. часы отстают. Но сколько это в сек/сутки ? Может это отставание внутри обычной погрешности хода часов. В герметичных часах атмосферное давление никак не влияет. А вот на высоте может проявится "эффект близнецов", т.е. само время течёт медленнее
)